החיסון של פייזר אושר עבור מתבגרים בגילאים 12-17 במאי 2021, בהתבסס על מחקר phase III. החל מיוני 2021 החלו להתקבל דיווחים על דלקת בשריר הלב לאחר מנת החיסון השניה. למרות שההערכות הסיכון לעומת תועלת נטו לטובת החיסון, ה-CDC וה-FDA ערכו מחקר נוסף בין דצמבר 2020 ויולי 2021.
מתוך 8.9 מליון חיסונים שניתנו 0.1% דיווחו על תופעות לוואי, מתוכם 90.7% היו תופעות קלות, בעוד שהשאר הוגדרו כחמורות (כולל דלקת בשריר הלב). תופעות הלוואי החמורות הנפוצות ביותר כללו כאבים בחזה, עליה ברמות הטרופונין, דלקת בשריר הלב ועליה ברמות ה-c-reactive protein.
מרבית המקרים ארעו בקרב מחוסנים בגילאים 12-15 (בעיקר בקרב בנים). לא אירעו כל מקרי מוות.
הועדה לחיסונים המליצה להמשיך לתת את החיסון לקבוצת גיל זו.