ההשפעה החיובית על בריאות הכבד נצפתה ללא קשר לצריכה של קפה נטול קפאין או רגיל.
חוקרים מה- National Cancer Institute ציינו שתיית קפה מדי יום מועילה לבריאות הכבד, משפרת את פעולתו וייתכן כי אף מונעת תחלואה.
במסגרתו של סקר הבריאות שנערך מצאו החוקרים כי אנשים ששתו קפה – הן רגיל והן נטול קפאין – היו בעלי סבירות נמוכה יותר להציג רמות גבוהות של סמנים ביולוגיים המעידים על פגיעה בתפקודי הכבד, כולל aminotransferase, aminotransferase, alkaline phosphatase, ו- gamma glutamyl transaminase.
רמות גבוהות של האנזימים הללו מהוות פעמים רבות סמן לפגיעה בכבד וקשורות לבעיות כגון סוכרת, מחלות קרדיווסקולאריות, כבד שומני שאינו תוצאה של צריכת אלכוהול, שחמת הכבד וסרטן הכבד.
ניתוח של הרגלי צריכת הקפה ובדיקות דם שנאספו מיותר מ- 27,793 נבדקים מגיל 20 ומעלה במסגרתו של ה- U.S. National Health and Nutrition Examination Survey מצא כי אנשים השותים קפה מציגים רמות נמוכות של האנזימים הללו. ההשפעה החיובית על בריאות הכבד נצפתה ללא קשר לסוג הקפה – רגיל או נטול קפאין – ממצא המציע כי מרכיבים אחרים מלבד הקפאין בעלי השפעה על בריאות הכבד.